Este post se lo dedico a Loretahur, a la que admiro en sus múltiples facetas y que en un plis-plas me ha solucionado el problema de alojamiento de la visualización en TouchGraph. Muchas gracias Lorena.

TouchGraph es un programa escrito en java que permite visualizar y navegar interactivamente por redes de información interrelacionada. Existen dos modalidades, una versión liberada en sourceforge y una versión de pago propiedad de Google. He querido probar ambas versiones antes de publicar este post.

Aunque en la versión liberada la documentación es escasa, no me costó mucho hacerla funcionar. Sin embargo, TouchGraph Navigator, la versión de pago, ha resultado ser muy cansina. Durante dos semanas he intentado hacer que visualizase la propagación de El meme de Enjut@ Mojamut@ con resultados desconcertantes. Al final he llegado a la conclusión de que está limitado el numero de nodos de la red, no sé si en la versión de evaluación que me descargado o si el problema también existe en la versión de pago. Al menos he acotado el problema y he podido ver como funciona.

Por razones de extensión en este post se explicará como visualizar con la versión liberada de TouchGraph y dejaré para un segunda parte cómo usar TouchGraph Navigator y no morir en el intento.

Pulsando en la siguiente figura se accederá a la visualización de la propagación del meme de Enjut@ Mojamut@. Pido disculpas, pero solo funciona en Firefox.

Ayuda a la navegación:

Situación inicial:

1. Aparecen todos los nombres de los blogs agrupados. Situar el ratón encina de los nombres hasta que aparezca la palabra inicio.
2. Pulsar con el botón derecho del ratón y en el menú asociado seleccionar “Expand node”
3. Se desplegará la visualización.

Navegación:

• Barra superior: Controla el zoom. Hacia la derecha aumenta y hacia la izquierda disminuye
• Barra inferior: Controla el scroll
• Cursor sobre el nodo: Aparece información sobre el blog
• Botón derecho del ratón: Permite, expandir, comprimir o seleccionar el nodo
• Botón izquierdo del ratón: Enlaza al blog seleccionado en ese momento.

Información de los nodos:

• Color: Los nodos morados son de blogueras y los rojos son de Blogueros
• Formas: El rectángulo con esquinas redondeadas representa a los blogs que han propagado el meme y el rectángulo  a los blogs que no lo han propagado.
• Tamaño de letra: Las letras de tamaño grande corresponden a los blogs que han propagado indirectamente más de 10 memes, las letras más pequeñas a los que no han propagado ningún meme y las letras de tamaño mediano al resto.
• Número asociado: indica que el nodo está comprimido y que se puede expandir en n conexiones

¿Cómo lo he hecho?

Como ya es costumbre, para poder mostrar que la visualización no es algo complejo se utilizará el mismo método de explicación que en las herramientas GraphViz y Pajek. mediante un procedimiento en tres pasos:

Preparar datos de origen: Los datos del meme recogidos en una hoja de cálculo se salvan en formato texto separados por tabulaciones.

Transformar datos a formato .xml: Se aplica un filtro awk al fichero de texto separado por tabulaciones y se genera un fichero en formato xml.

Generar el gráfico: Se procesa el fichero .xml con el programa TouchGraph

• Filtro awk: memes_precedencias_touchgraph.awk
• fichero xml generado: precedencias.xml
• Comando para generar el fichero .xml

Entorno de ejecución local:

• Es necesario bajarse el  awk para Windows, tener instalada la maquina java y descargarse Touchgraph libeado.

Entorno de ejecución en servidor con java:

• Subir a un directorio: BrowserLauncher.jar, nanoxml-2.1.1.jar, TGGraphLayout.jar, TGLinkBrowser.jar, el fichero html para lanzar la visualización y el fichero xml.

Esta semana me encontré a mi misma. Buscando en Internet aterricé en el simposio de Visualizar que organizó Medilab Prado en noviembre de 2007. Allí estaba el programa del simposio y en la parte de comunicaciones, mi nombre seguido de un enlace a +info. Al pinchar me encontré a mi misma hablando de BarriBlog:

Como comentaba en el post anterior, Pajek es más que un visualizador de grafos, es un programa de análisis de redes que nos permite descubrir características de los nodos de la red.

Una de las funcionalidades que ofrece Pajek es el cálculo de la matriz geodésica. Esta matriz contiene todos los posibles caminos de distancia geodésica entre los nodos de la red. La distancia geodésica es “el número mínimo de pasos de un nodo a otro“.

La figura que encabeza este post (pulsando en la imagen se puede ver a tamaño real), visualiza la matriz geodésica que nos muestra la conectividad total entre todos los nodos y nos permite apreciar visualmente los nodos que más han favorecido la propagación de El meme de Enjut@ Mojamut@: Seccion Femenina, Colgado de las telecomunicaciones, Consultoria artesana en red, Carlos Garcia Argos , El albañil de Software, BarriBlog, El bloc de Carmen Pla, Opcion Web, Gamoia,
Pisito en Madrid, Diario de una profesional con niños, Tiscar.com, Freak s city, Hecho en Marbella y Eduardo Collado.

Alguno de los que han participado en este meme los estoy siguiendo en Twitter, como @tiscar, @fernand0,@carmepla, @petezin,@chiqui, @amfumero, @davidbs, @julen, @pisitoenmadrid,@ecollado,@ebrito, @emper, @labambola.

Es pequeñito el barrio y coincidimos en muchos sitios.

Este post documenta el uso de la herramienta Pajek para visualizar la propagación del meme de Enjut@ Mojamut@, por tanto continua a la saga: Exprimiendo el meme de Enjut@ Mojamut@, Juntos pero no revueltos y Visualizando con GraphViz el meme de Enjut@ Mojamut@.

El proyecto Pajek, traducción del slovenio ‘Araña’, fue creado en 1996 por Vladimir Batagelj y Andrej Mrvar de la Universidad de Ljubljana, Slovenia. El Software de Pajek funciona bajo la plataforma de Windows y es de libre distribución para uso no comerciales. Es una herramienta muy completa para los que estudian redes complejas, entre ellas las sociales. En este manual se describen todas sus posibilidades. Entre sus funciones está la de visualizar grafos, cuyas posibilidades se explicarán a lo largo de este post.

Pajek trabaja con un formato de entrada .net. No tiene definida la gramática formal, pero se se ajusta a esta notación BNF.

Para poder mostrar que la visualización no es algo complejo se utilizará el mismo método de explicación que en la herramienta GraphViz. mediante un procedimiento en tres pasos:

Preparar datos de origen: Los datos del meme recogidos en una hoja de cálculo se salvan en formato texto separados por tabulaciones.

Transformar datos a formato .net: Se aplica un filtro awk al fichero de texto separado por tabulaciones y se genera un fichero en formato net.

Generar el gráfico: Se procesa el fichero .net con el programa Pajek

Al pulsar en las imágenes aparecerán en su tamaño real.

Se han realizado tres visualizaciones en 2D, cada una con un layout distinto. El filtro awk aplicado y el fichero .net generado es el mismo para las los tres layouts:

• Filtro awk: memes_precedencias_pajek.awk
• fichero net generado: precedencias.net
• Comando para generar el fichero .net

Entorno de ejecución es Windows

Pajek permite generar grafos en dos o tres dimensiones con distintos layouts y exportar a distintos formatos.

Este post es la continuación de la entrada “Juntos pero no revueltos” y aquí se publicarán algunas visualizaciones estáticas del meme de Enjut@ Mojamut@ y el proceso que he seguido para obtenerlas. El objetivo es mostrar que visualizar está al alcance de todos los que quieran ponerse a ello.

El pasado mes de marzo en un post titulado “Graphviz” se describió esta herramienta ilustrándola con varios ejemplos de visualización realizados por Gustavo Romero, estudiante de Telecomunicaciones en la Universidad Carlos III. Basándome en su experiencia (tuvo la amabilidad de pasarme sus fuentes) la he aplicado al meme de Enjut@ Mojamu@ haciendo algunos cambios en el tipo de herramienta de filtrado de datos. A continuación se describe el procedimiento en tres pasos:

Preparar datos de origen: Los datos del meme recogidos en una hoja de cálculo se salvan en formato texto separados por tabulaciones.

Transformar datos a formato dot: Se aplica un filtro awk al fichero de texto separado por tabulaciones y se genera un fichero en formato dot.

Generar el gráfico: Se procesa el fichero dot con el programa Graphviz.

Se han realizado tres visualizaciones que se presentan a continuación indicando el filtro awk aplicado, el fichero dot generado y el tipo de visualización elegida. En el post de Graphviz se explican los tipos de visualización de esta herramienta.

Al pulsar en las imágenes aparecerán en su tamaño real.

	Grafo libre: Esta visualización corresponde al dibujo de la propagación del meme sin ninguna restricción. Filtro awk: memes_precedencias.awk fichero dot generado: precedencias.dot Formato de salida: fdp (implementa el heurístico Fruchterman-Reingold) Comando para generar el fichero dot
	Grafo por nivel de propagación: esta visualización corresponde al dibujo de la propagación del meme en la que se ha forzado a que los nodos se sitúen en su nivel de propagación. Filtro awk: memes_precedencias_nivel.awk fichero dot generado: precedencias_nivel.dot Formato de salida: dot Comando para generar el fichero dot
	Grafo por tiempo de propagación: esta visualización corresponde al dibujo de la propagación del meme en la que se ha forzado a que los nodos se sitúen en su día publicación. Filtro awk: memes_precedencias_tiempo.awk fichero dot generado: precedencias_tiempo.dot Formato de salida: dot Comando para generar el fichero dot

Entornos de ejecución